(一)混雜

蜜蜂的交尾活動是在空中進行，婚飛半徑可達5-8公里，而且處女蜂王喜與外場的異種雄蜂交尾，這是造成種群混雜的主要原因。其次，是蜂場在育王時，沒進行有效選種，雄蜂多是養蜂人員檢查蜂群時漏網的幸存者，從而導致蜂群混雜，良種種性退化。

(二)高度近親繁殖

由于受養蜂場地的限制(如大山區)或蜂群過小，又過分強調“純繁”，面形成高度近親繁殖。由此導致蜂群生活力、繁殖力下降，抗病力減弱，采集能力變低，群勢發展不起來，嚴重影響生產。

(三)不科學育王

在移蟲時，蟲齡過大(超過20時齡)；哺育群蜂量不足，尤其是哺育蜂數量少，花粉飼料不足，而導致蜂王發育不良。另外，在育王時，母群移蟲前基本沒有控制蜂王產卵，卵偏小，用這樣的小卵孵出來的幼蟲育王，一般處女王的生產均達不到指標，產卵力越來越低。加上種用雄蜂未徑專門選擇、培育，父群飼料不足，雄蜂發育不良，蜂王質量也會越來越差。

(四)飼養管理方法失當

不管蜂種的生產力、生物學特性如何，千篇一律采用同一的飼養管理方法，使其優良性不能發揮；管理不當，破壞了蜂群的正常生活秩序，既妨礙幼蟲的健康發育，也會妨礙工蜂的正常采集活動和內勤工作。

(五)不良環境條件

許多優良蜂種都需要有與之相適應的地理、蜜源、氣候條件，故蜜蜂有“地理宗”、“地理亞宗”以及“生態型”之分。如果在引種、用種時忽視這些條件，而導致蜂群某些優良性能退化進而導致種群退化，也是蜂種退化的原因之一。