一、定義不同

土蜂蜜是特指土蜂(中蜂)采集多種蜜源植物釀制成的蜂蜜，而百花蜜是指包含兩種或兩種以上蜜源且任何一種蜜源都不占優勢的蜜種，從定義上來看土蜂蜜實際上應該算是百花蜜中的一種，但為了區別中蜂釀制的百花蜜和意蜂釀制的百花蜜，人們往往用土蜂蜜來特指中蜂采集多種植物花蜜釀制的百花蜜。

二、蜂種不同

土蜂蜜是中蜂(中華蜜蜂)釀制而成的，中蜂是我國本土的蜂種，善于利用零星蜜源，但對大蜜源的采集力不如意蜂，而目前市場上的百花蜜大多數都是意蜂釀制的，意蜂是我國引進的優良蜂種，對大宗蜜源有極強的采集力，另外中蜂的產量不如意蜂，如果中蜂的產量是以十為單位則意蜂就是以百為單位。

三、蜜源不同

土蜂蜜的蜜源種類極為復雜且多變，源于中蜂的采集對象非常廣泛并善于利用零星蜜源，也就是說不管是大蜜源還是零星蜜源只要在采集范圍內中蜂都會采，而意蜂一般只對成片的大蜜源感興趣，幾乎很少像中蜂那樣采集零星蜜源，因此中蜂釀制的土蜂蜜和意蜂釀制的百花蜜在蜜源多寡上有很大的區別。

四、價格不同

土蜂蜜是目前市場上售價最高的蜜種，導致其價格昂貴的原因主要有三個，其一是土蜂蜜比一般蜂蜜更富營養價值，其二是土蜂蜜一般都是中蜂完全釀制成熟的封蓋蜜，其三是土蜂蜜產量稀缺導致的物以稀為貴，而意蜂釀制的百花蜜在價格上要便宜得多，甚至可能還比不上某些質量較好且純正的單花蜜。

總結：土蜂蜜和百花蜜是按不同依據劃分的蜜種，其中土蜂蜜特指中蜂釀制的蜂蜜，而百花蜜則是指多種花蜜釀成的混合蜜，嚴格說來土蜂蜜也是百花蜜的一種，因此兩者既有相似性也存在著不同。