一、蜜源不同

荔枝蜜和龍眼蜜在蜜源上截然不同，其中荔枝蜜的蜜源植物是無患子科荔枝屬植物荔枝，一個荔枝花期每個意蜂生產群可產荔枝蜜約20～40斤，而龍眼蜜的蜜源植物是無患子科龍眼屬植物龍眼，一個龍眼花期每個意蜂生產群可產龍眼蜜約40～60斤。

二、產地不同

荔枝蜜和龍眼蜜在產地上不盡相同，其中荔枝蜜的產地就是荔枝樹的集中分布地，尤以廣東、福建、廣西、云南、四川、貴州等地分布最為集中，而龍眼蜜的產地則是龍眼樹的集中分布地，主要以福建、廣東、廣西、臺灣、海南等地分布最為集中。

三、外觀不同

荔枝蜜和龍眼蜜在外觀上略有差異，其中荔枝蜜多呈琥珀色的粘稠液體狀，有濃烈的荔枝所特有的花香味，易結晶且結晶后呈細膩的乳白色，而龍眼蜜則多呈琥珀色或深琥珀色，有濃烈的龍眼所特有的花香味，不易結晶且結晶后呈琥珀色的粗粒狀。

四、價格不同

荔枝蜜和龍眼蜜在價格上稍有不同，其中荔枝蜜的價格一般在30～50元一斤，極少數品質好的荔枝蜜可賣到60～80元，而龍眼蜜的價格一般在30～50元一斤，極少數品質好的龍眼蜜也可賣到60元以上，因此價格上荔枝蜜和龍眼蜜并沒有太大的區別。

綜上所述，荔枝蜜和龍眼蜜雖然同屬南方的特色蜜種，但實際上二者是截然不同的兩個蜂蜜品種，其中荔枝蜜是蜜蜂采集荔枝樹花蜜釀制成的，而龍眼蜜則是蜜蜂采集龍眼樹花蜜釀制成的。